MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 plasmid pcpNJ1

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018637	A	8	8	47	54	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018637	TCT	2	6	96	101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018637	TA	3	6	186	191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018637	GAT	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018637	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018637	ATT	2	6	235	240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018637	ATT	2	6	1301	1306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018637	TTG	2	6	3782	3787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018637	A	8	8	3794	3801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018637	TTAAA	2	10	3802	3811	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018637	TTAA	2	8	4647	4654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018637	AT	3	6	4655	4660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018637	T	9	9	4673	4681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018637	A	6	6	4693	4698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018637	GA	3	6	4717	4722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018637	CAG	2	6	6588	6593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018637	GAA	2	6	6647	6652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018637	GGT	2	6	6664	6669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018637	GGT	2	6	6686	6691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018637	GGT	2	6	6708	6713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018637	GGT	2	6	6730	6735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018637	A	7	7	6749	6755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018637	CAC	3	9	6817	6825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_018637	ATT	2	6	6834	6839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018637	AGC	2	6	6855	6860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018637	AGAA	2	8	6895	6902	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018637	TAG	2	6	6926	6931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018637	AT	3	6	6938	6943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018637	TGT	2	6	6976	6981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018637	AGC	2	6	7068	7073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018637	TA	3	6	7078	7083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018637	TTA	2	6	7121	7126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018637	AG	3	6	7210	7215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018637	GTT	2	6	7218	7223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018637	T	6	6	7225	7230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018637	A	6	6	7368	7373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018637	AGGTAA	2	12	7394	7405	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018637	AG	3	6	7453	7458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018637	ACA	2	6	7485	7490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018637	AATC	2	8	7497	7504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018637	TAT	3	9	7510	7518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.